Su esposa, María de las Mercedes Fernández Carril; hijos, María de las Mercedes, Juan Manuel y Francisco Undagoitia Fernández; hijos políticos, Marcos Antonio y Rosana; nietos, Marco e Izan; hermanas, Angelines (†), M.ª José y Guadalupe Undagoitia Aspra; hermanos políticos, José Antonio, M.ª Luz y Manolo, Rosa y Carlos, Pepi y Víctor, Esteli y Elías, Violeta y Amable; tíos, sobrinos, primos y demás familia