Su esposa, Nieves Santos Amate; hijos, Jesús Manuel, Julia, Amador y Víctor (sacerdote Agustino) Fernández Santos; hijos políticos, Eva Álvarez Rodríguez y Alberto Álvarez Lozano; nietos, Candela y Martina Fernández Álvarez y Borja Álvarez Fernández; padres, Jesús () y Carmen (); hermanos, Víctor Luis (), Olvido, Sara (), Alejandrina () (religiosa), José Luis () y Roberto Fernández Pando; hermanos políticos, sobrinos, primos y demás familia